Het Project Mainportontwikkeling Rotterdam (PMR) bestaat uit de ontwikkeling van Maasvlakte 2, de aanleg van 750 ha nieuw natuur- en recreatiegebied en een cluster aan kleinere projecten in Bestaand Rotterdams Gebied. Gerbrand Naeff is betrokken sinds de vernietiging in januari 2005 van de Planologische Kernbeslissing voor PMR. De eerste jaren intensief met herstel van de PKB en de bestemmingsplannen en vergunningen voor Maasvlakte 2. De laatste jaren beperkt met de afronding van de besluiten voor 750 ha natuur- en recreatiegebied, vooral het Buytenland van Rhoon.

Opdrachtgever: Ministerie van IenM (2005 - 2012)

Vanaf de zomer 2009 is Gerbrand Naeff lid van het projectteam van Rijkswaterstaat voor het opstellen van een plan voor de Toekomst van de Afsluitdijk. Aanleiding is dat de dijk niet meer voldoet aan de veiligheidseisen. Ambitie is een integrale gebiedsgerichte aanpak. Consortia van bedrijven hebben vernieuwende visies ingebracht. Gerbrand heeft het opstellen van het Plan-MER en de Passende Beoordeling begeleid en is schrijver van de structuurvisie, waarin de voorkeursbeslissing is opgenomen. De staatssecretaris van IenM heeft de Structuurvisie Toekomst Afsluitdijk eind 2011 vastgesteld. Bij de in 2012 gestarte planuitwerking is Gerbrand betrokken bij de opzet van het Project-MER.

Opdrachtgever: Rijkswaterstaat (2009-2012)

Het Apeldoorns Kanaal loopt over een lengte van ruim 10 km door de bebouwing van Apeldoorn. De zone langs het Kanaal is van oudsher bedrijventerrein. De zone moet een nieuwe functie krijgen: modern bedrijventerrein, woongebied en stadscentrum. Naeff Consult heeft geholpen de ambities om te zetten in plannen volgens een open planproces met inbreng van de voornaamste stakeholders uit de stad. Het resultaat is een planconcept met duurzaamheid als belangrijke factor dat wordt gedragen door een breed samengestelde stuurgroep.

Opdrachtgever: gemeente Apeldoorn (1998 – 2004)

Evertsoord is een kerkdorp in de gemeente Horst aan de Maas. In dit jonge ontginningsgebied maakten de bewoners zich in toenemende mate zorgen over hun toekomst: de economie, maar vooral de (sociale) leefbaarheid. Het gebied is als GIDO-pilot (zie onder GIDO) opgepakt. Uitgangspunt was dat de bewoners zelf bepalen en beslissen wat de knelpunten en oplossingen voor de leefbaarheid van hun dorp zijn. De rolverdeling met de gemeente was speciaal: de gemeente had een dienende rol – het initiatief lag niet bij de overheid, maar bij de gemeenschap zelf. De energie van de bewoners was groot. Op papier is een vertrouwenspact Leefbaarheid Evertsoord opgesteld met tal van praktische uitwerkingen.
Gerbrand Naeff begeleidde namens de GIDO Stichting dit proces een paar jaar.